Palavras-chave
meningite
PCR em tempo real
Como Citar
Resumo
O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616 amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar diagnóstico laboratorial no período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células. Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %, respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública no Estado de São Paulo.
Referências
1. Knowles NJ, Hovi T, Hyypiä T, King AM, Lindberg AM, Pallansch MA, et al. Picornaviridae. In: Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier; 2012.p.855-80.
2. Pallansch MA, Roos RP. Enteroviruses: polioviruses, coxsackieviruses, echoviruses, and newer enteroviruses. In: Knipe DM, Howley PM. 4ª ed. Philadelphia (PA): Lippincott Williams and Wilkins; 2001.p.723-75.
3. Abzug MJ. Presentation, diagnosis, and management of enterovirus infections in neonates. Paediatr Drugs. 2004;6(1):1-10. [DOI:10.2165/00148581-200406010-00001].
4. King RL, Lorch SA, Cohen DM, Hodinka RL, Cohn KA, Shah SS. Routine cerebrospinal fluid enterovirus polymerase chain reaction testing reduces hospitalization and antibiotic use for infants 90 days of age or younger. Pediatrics. 2007;120(3):489–96. [DOI:10.1542/peds. 2007-0252].
5. Romero JR. Reverse-transcription polymerase chain reaction detection of the enteroviruses. Arch Pathol Lab Med. 1999;123:1161-9.[DOI:10.1043/0003-998528-199929123<1161].
6. Nijhuis M, Van Maarseveen N, Schuurman R, Verkuijlen S, De Vos M, Hendriksen K, et al. Rapid and sensitive routine detection of all members of the genus enterovirus in different clinical specimens by real-time PCR. J Clin Microbiol. 2002;40(10):3666-70.[DOI:10.118/JCM-40.10.3666-3670.2002].
7. Pabbaraju K, Wong S, Wong AA, Tellier R. Detection of enteroviruses and parechoviruses by a multiplex real-time RT-PCR assay. Mol Cell Probes. 2015;29(2):81-5. [DOI:10.1016/j.mcp.2015.02.001].
8. Giulieri SG, Chapuis-Taillard C, Manuel O, Hugli O, Pinget C, Wasserfallen JB, et al. Rapid detection of enterovirus in cerebrospinal fluid by a fully-automated PCR assay is associated with improved management of aseptic meningitis in adult patients. J Clin Virol. 2015;62:58-62. [DOI:10.1016/j.jcv.2014.11.001].
9. Hierholzer JC, Killington RA. Virus isolation and quantification. In: Virology Methods Manual: Kangro HO, Mahy BWJ. London: Academic Press; 1996.p.24-45.
10. Verstrepen WA, Bruynseels P, Mertens AH. Evaluation of a rapid real-time RT-PCR assay for detection of enterovirus RNA in cerebrospinal fluid specimens. J Clin Virol. 2002;25:39-43. [DOI:10.1016/S1386-6532(02)00032-X].
11. Landis JR, Koch GG. The measurement of observer agreement for categorical data.Biometrics. 1977;33(1):159-74.[DOI:10.2307/2529310].
12. Oberste MS, Peñaranda S, Rogers SL, Henderson E, Nix WA. Comparative evaluation of Taq Man real time PCR and Semi nested VP1 PCR for detection of enteroviruses in clinical specimens. J Clin Virol. 2010;49(1):73-4. [DOI:10.1016/j.jcv.2010.06.022].
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Copyright (c) 2016 Bráulio Caetano Machado, Heloísa Rosa Vieira, Mayara Rhaissa de Moraes Alves, Rita de Cássia Compagnoli Carmona