Análise genômica comparativa de isolados clínicos e ambientais de Klebsiella pneumoniae produtoras de carbapenemases no contexto da Saúde Única
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Keywords

Klebsiella pneumoniae
Enterobacteriaceae Produtoras de Carbapenemase
Saúde Única

How to Cite

1.
Krul D, Siqueira AC, Negoseki BR da S, Sousa I de, Mesa D, Conte D, Dalla-Costa LM. Análise genômica comparativa de isolados clínicos e ambientais de Klebsiella pneumoniae produtoras de carbapenemases no contexto da Saúde Única. Rev Inst Adolfo Lutz [Internet]. 2024 Nov. 3 [cited 2025 Feb. 5];83:e40810. Available from: https://periodicos.saude.sp.gov.br/RIAL/article/view/41286

Abstract

O complexo de espécies Klebsiella pneumoniae (KpSC) é composto por microrganismos ubíquos, que podem causar
infecções hospitalares. A espécie de maior destaque é K. pneumoniae sensu stricto, classificada pela organização mundial da saúde (OMS) como patógeno bacteriano prioritário para pesquisa e desenvolvimento de novos antimicrobianos. Essa espécie apresenta uma plasticidade genômica e elevada capacidade de aquisição, e transferência de genes de resistência aos antimicrobianos. Nesse contexto, nosso estudo teve como objetivo realizar uma análise comparativa das características fenotípicas e genotípicas de isolados clínicos e ambientais de KpSC. As amostras foram coletadas nas quatro estações do ano, no período de 2022-2023, em um hospital pediátrico terciário, sendo incluídos 33 isolados resistentes aos carbapenêmicos. Destes, sete isolados clínicos (cinco amostras de sangue e duas de swab retal) e 26 isolados de efluente hospitalar. A identificação foi realizada por MALDI-TOF MS e o teste de susceptibilidade aos antimicrobianos por microdiluição em caldo. O DNA genômico foi extraído e sequenciado em plataforma Illumina NextSeq 1000. A espécie prevalente foi K. pneumoniae sensu stricto (51,5%), seguida de K quasipneumoniae subsp. similipneumoniae (45,5%). Quanto à resistência aos carbapenêmicos, 100% dos isolados foram resistentes ao ertapenem, 48,5% resistentes ao imipenem e 45,5% resistentes ao meropenem. Esse perfil de resistência se justifica pela presença dos seguintes genes: blaKPC-2 (91%), blaNDM-1 (6,0%) e blaKPC-3 (3,0%). Foram identificadas oito sequências tipo (STs): ST3318 (27,3%), ST392 (24,2%), ST11 (15,2%), ST367 (15,2%), ST872 (9,1%), ST530 (3,0%), ST735 (3,0%) e uma nova combinação de alelos o ST7147 (3,0%). O ST392 foi encontrado tanto em amostras clínicas quanto ambientais em diferentes períodos, revelando uma possível disseminação horizontal entre nichos ecológicos. A presença de bactérias resistentes em efluente hospitalar é considerada um problema de saúde pública no contexto da Saúde Única, pois esses contaminantes são liberados em águas superficiais e podem persistir, favorecendo a transmissão horizontal de genes de resistência.

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Copyright (c) 2024 Damaris Krul, Adriele Celine Siqueira, Bianca Ribeiro da Silva Negoseki, Inayara de Sousa, Dany Mesa, Danieli Conte, Libera Maria Dalla-Costa

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