PREVALÊNCIA DOS SUBTIPOS CIRCULANTES DO HIV-1 EM PACIENTES ASSISTIDOS PELA REDE NACIONAL DE GENOTIPAGEM (RENAGENO) NA REGIÃO DE SÃO JOSÉ DO RIO PRETO

Abstract

O HIV-1 está dividido em 3 grupos diferentes M, N e O. O grupo M, mais prevalente, apresenta 9 subtipos (A - D, F - H, J e K) e progressivamente foram descritos 43 formas circulantes recombinantes. Estudos indicam que no Brasil o subtipo B o mais prevalente, seguido pelos subtipos F e C, com poucos casos dos subtipos D e A. Pesquisas mostram que os subtipos B, F e formas recombinantes B/C e B/F são mais prevalentes nas regiões  sudeste e sul, e um aumento da prevalência do subtipo C no sul do país. Nosso objetivo foi estimar a prevalência dos subtipos do HIV-1 na região de São José do Rio Preto, avaliando dados laboratoriais de pacientes HIV positivo, atendidos pela Rede Nacional de Genotipagem (RENAGENO) doMinistério da Saúde, no período de janeiro de 2010 a julho de 2012. Os resultados foram obtidos utilizando a metodologia de genotipagem TRUGENE? HIV-1 Genotyping Assay - Open Gene DNA Sequencing System, que tem como alvo a região da protease (codons 1 to 99) e a região da transcriptase reversa (codon 40 to 247) do genoma do HIV-1. As amostras após sequenciadas foram analisadas e editadas. Arquivos FASTA e csv gerados após a edição foram submetidos ao Algoritmo Brasileiro de Genotipagem para obtenção dos laudos de resistência com subtipagem. Os resultados obtidos mostraram que das 422 amostras sequenciadas, 331(78,4%) foram do subtipo B; 22 (5,2%) do subtipo F1 e 14 (3,3%) do subtipo recombinate BF1; 1,4% do subtipo C e aproximadamente 11% n?-subtipadas. Nossos resultados demonstram concordância com as recentes pesquisas publicadas, com uma grande prevalância de HIV-1 subtipo B, seguido por HIV-1 subtipons B, sendo encontrados subtipos F e recombinantes BF. O monitoramento da diversidade estrutural do HIV-1 auxilia na compreensão da epidemiologia molecular e no rastreamento do movimento do vírus nos diferentes grupos vulneráveis.