Extração de DNA de biópsias de pele fixadas em formalina tamponada e embebidas em parafina e amplificação por PCR
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Palavras-chave

epidemiologia molecular
banco de DNA
PCR
dermatologia
hanseníase

Como Citar

1.
Pereira AC, Souza VB de, Dias-Baptista IMF. Extração de DNA de biópsias de pele fixadas em formalina tamponada e embebidas em parafina e amplificação por PCR. Hansen. Int. [Internet]. 30º de novembro de 2008 [citado 22º de novembro de 2024];33(2):25-30. Disponível em: https://periodicos.saude.sp.gov.br/hansenologia/article/view/36239

Resumo

Biópsias de pele oriundas dos serviços de diagnóstico da hanseníase podem ser grande fonte de material para estudos retrospectivos em genética humana e do Mycobacterium leprae. No entanto, os procedimentos de fixação e inclusão em parafina podem dificultar a obtenção de DNA de qualidade para amplificação por PCR. Assim, estas amostras requerem protocolos especiais para a extração do material genético. O objetivo deste trabalho é apresentar um método alternativo para extração de DNA com base na combinação de calor e digestão enzimática. Para tanto, os cortes foram aquecidos a 120º C em solução tampão de pH 9,0, submetidos à digestão enzimática com proteinase K e o DNA foi extraído por meio de solução de fenol:clorofórmio:álcool isoamílico. A amplificação por PCR para as regiões dos genes humanos TNF e LTA foi bem sucedida para 85,4% dos espécimes. Considerando o DNA do M. leprae, obtivemos
amplificação em 67,6%, 48,5%, 36,7% e 64,8% para os marcadores TA18, GTA9, TTC e RLEP, respectivamente.
Concluímos que este é um método de baixo custo que proporcionou um rendimento satisfatório de DNA de
boa qualidade para emprego em PCR a partir de biópsias parafinadas de pele.

https://doi.org/10.47878/hi.2008.v33.36239
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Referências

1 Alter A, Alcaïs A, Abel L, Schurr E. Leprosy as a genetic model for susceptibility to common infectious diseases. Hum Genet 2008 Apr;123(3):227-35.
2 Schewe C, Goldmann T, Grosser M, Zink A, Schlüns K, Pahl S, Ulrichs T, Kaufmann SH, Nerlich A, Baretton GB, Dietel M, Vollmer E, Petersen I. Inter-laboratory validation of PCR-based detection of Mycobacterium tuberculosis in formalin-fixed, paraffinembedded tissues. Virchows Arch 2005 447(3):573-85.
3 Shi SR, Cote RJ, Wu L, Liu C, Datar R, Shi Y, Liu D, Lim H, Taylor CR. DNA extraction from archival formalin-fixed, paraffinembedded tissue sections based on the antigen retrieval principle: heating under the influence of pH. J Histochem Cytochem 2002 50(8):1005-11.
4 Coombs NJ, Gough AC, Primrose JN. Optimisation of DNA and RNA extraction from archival formalin-fixed tissue. Nucleic Acids Res 1999 27(16): e12.
5 Coura R, Prolla JC, Meurer L, Ashton-Prolla P. An alternative protocol for DNA extraction from formalin fixed and paraffin wax embedded tissue. J Clin Pathol 2005 58:894-5.
6 Faulkner SW, Leigh DA. Universal amplification of DNA isolated from small regions of paraffin-embedded, formalin-fixed tissue. Biotechniques 1998 24(1):47-50.
7 Simonato, Luciana Estevam; Garcia, José Fernando; Nunes, Cáris Maroni; Miyahara, Glauco Issamu. Evaluation of two methods of DNA extraction from paraffin-embedded for PCR amplification. J Bras Patol Med Lab 2007 43(2):121-7.
8 Mesquita RA, Anzai EK, Oliveira RN, Nunes FD. Avaliação de três métodos de extração de DNA de material parafinado para amplificação de DNA genômico pela técnica da PCR. Pesqui Odontol Bras 2001 15(4):314-9.
9 Santos AR, Suffys PN, Vanderborght PR, Moraes MO, Vieira LM, Cabello PH, Bakker AM, Matos HJ, Huizinga TW, Ottenhoff TH, Sampaio EP, Sarno EN. Role of tumor necrosis factor-alpha and interleukin-10 promoter gene polymorphisms in leprosy. J Infect Dis 2002 Dec 1;186(11):1687-91.
10 Truman R, Fontes AB, De Miranda AB, Suffys P, Gillis T. Genotypic variation and stability of four Variable-Number Tandem Repeats and their suitability for discriminating strains of Mycobacterium leprae. J Clin Microbiol 2004 Jun; 42(6):2558-65.
11 Goulart IM, Cardoso AM, Santos MS, Gonçalves MA, Pereira JE, Goulart LR. Detection of Mycobacterium leprae DNA in skin lesions of leprosy patients by PCR may be affected by amplicon size. Arch Dermatol Res 2007 299(5-6):267-271.
12 Frannk TS, Svoboda-Newman SM, Hsi ED. Comparison of methods for extracting DNA from formalin-fixed paraffin sections for nonisotopic PCR. Diagn Mol Pathol 1996 5(3):220-4.
13 Crisan D, Mattson JC. Retrospective DNA analysis using fixed tissue specimens. DNA Cell Biol 1993 12(5):455-64.
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